穿越者朱翊鈞反對漕運而支持海運的原因相當簡單。
因為大運河的開鑿本身就違背自然規律，而在違背自然規律的情形下，朝廷維持漕運的成本極大。
中國地勢西高東低，長江黃河等大河無不是自西向東發源于崇山峻嶺，并最終匯入海洋。
而京杭大運河從杭州至北京則是南北走向，橫跨長江、淮河、黃河、海河四大水系，跨越山峰、丘陵、平原等多種地形。
不僅南北落差大，而且部分河道如會通河段就存在嚴重的水源不足問題。
此外，會通河段還涉及將山東境內的數條河流一并匯入的問題，因此過洪過閘時經常需要人力拉纖，船夫水手無不深受其苦，出入關閘還經常有船只傾覆，動輒人船俱毀。
如果運河水位過高，修筑運河沿岸堤壩的費用可高達千萬兩，且河道狹窄僅能供單向行船，也增加了運輸的成本。
且大運河本身在每年都有嚴格的過洪過閘期限，必須嚴格遵循，否則夏季汛期和冬季的冰凍期都會導致河道受阻無法通航。
而這些所有有形、無形的成本無疑都將轉嫁到百姓身上，增加了農民的負擔。
所以無論后世如何稱贊大運河的偉大、如何稱贊下令鑿修大運河的君王，在朱翊鈞眼里，漕運仍然是用百姓的血淚堆積而成的一種暴政。
朱翊鈞就是這樣的一個人。
即使他成了皇帝，也無法發自內心地去贊美那一種“犧牲平民的偉大”。
即便這偉大是多么得巍峨壯麗，多么得千古流芳，朱翊鈞都無法心安理得地去用大明百姓的衣食之本去成全那一份不知餮足的致君堯舜。
何況漕運本就無關堯舜。
大明王朝建立之初，本來實行的是河海兼行。
朱元璋為掃平殘余北遁后盤踞于遼東地區的元順帝的北元政權的殘余勢力，必須保存海路以作為平叛北元的重要手段。
但到了朱棣定都北京之后，至永樂十三年，朝廷正式罷除全部海運而專行漕運。
當然當時決定專行漕運的理由也是相當正當的，朱翊鈞閉著眼都能數出那一二三來。
一是自永樂九年開始，朝廷重新開鑿了元代以來早已經廢棄不用的會通河，在很大程度上節省了百姓運力和龐大的海運耗費。
二是宋禮上書，認為海運相比內河漕運花費巨大，提出改為以河運漕糧為主的運送方式，并減少海運頻率為三年兩次，將江南富庶地區如揚州、鎮江等地糧食百萬余石，從內河用漕船運送至北京。
三是永樂十三年五月，平江伯陳揎開鑿清江浦河道的工程竣工，于淮河口筑新閘，疏浚運河，修筑湖堤，并于淮安、臨清等地修水次倉轉輸漕糧，不僅保障了會通河的充足水源，還使大運河正式全線貫通。
但是這些理由都掩蓋不了一個事實，就是漕運的本質，即是通過大運河剝削南方富庶地區的百姓財富來滿足北京這個國家政治中心的供應和需求。
換句話說，就是北京靠大運河源源不斷地在吸大明十三省的血。
所以明朝糧倉是否充裕，其實很大一部分原因不在于漕運數量的多寡，而在于北京官卒的數量。
而自永樂年間遷都之后，這部分人的數量急劇增長，北京地區人口的生存更加依靠于漕運。
因此明朝的漕運和其弊端是正相關關系，漕運越重要，朝廷對運河的依賴越緊密，由此產生的弊端也就越復雜。
到了晚明，漕運的弊端開始顯現得越發厲害，其中與黃河的關系尤為突出。
尤其是到了嘉靖以后，治漕的手段就是治河，治河的目的就是治漕。
因此即使晚明的財政時時困窘，在治漕治河的花費上卻一向是毫不吝惜。
但由于大運河本身的泥沙淤積、水源不足、以及過洪過閘的問題也時常發生，雖屢有治河名臣，但漕運自身的固有矛盾并未得到根本改善。
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